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研究:微菌群组分布特征可快速诊断疾病

一份新研究利用宏基因组学(the metagenomics),找到了人体内微菌不同群组细菌种类分布的规律,发现利用这种规律可以快速、准确地诊断很多种疾病。

​过去十年里,科学家已经了解到人体内部存在大量的微菌和病毒,而它们不同种类组成的特定的组合对人体各种系统,从消化、代谢到防疫系统起着重要的作用。但是科学家对它们究竟如何起作用还不了解,但是这对疾病的治疗有着重大意义。

近期一份来自美国德雷塞尔大学(Drexel University)发表在《公共科学图书馆:综合》(PLOS ONE)期刊上的研究对这个问题有了一些成果。

研究人员利用宏基因组学,将大量DNA和RNA样本扫描输入电脑,利用深度学习算法进行分析。大量的数据结合先进的电脑技术,科学家逐渐能够找到一些以往研究手段无法看到的规律。

​“比如我们发现一些微菌群组内同时存在大量大肠杆菌(E. coli)和脆弱拟杆菌(b.fragilis),它们的数量差不多,这可能意味着它们互相为对方提供食物。另一个群组内脆弱拟杆菌的数量最多,其他几种微菌数量差不多,但是都比脆弱拟杆菌的数量少,这可能说明它们都以脆弱拟杆菌提供的某种养分为食。”德雷塞尔大学工程学院的罗森(Gail Rosen)说。

研究者称,分析人体微菌群特征的一个最终目的是用各种微菌群的特征诊断疾病,如克隆氏症(Crohn’s disease,一种发炎性肠道疾病)和某些癌症等。

研究者用他们一些微菌群体规律与克隆氏症和口腔癌的菌群进行比较,结果显示,利用宏基因组学进行判断的准确率和目前其他诊断方法一样高,而所需的时间却大大缩短,从几天减少至几分钟。

​该研究组已将他们建立的宏基因组学分析工具公开,便利更多的研究人员参与研究找到疾病的治疗方案。

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